Le musée abrite des collections égyptiennes, que l'on doit à Charles Palanque (1865-1909), mais également des statues et fresques gallo-romaines issues de fouilles archéologiques, dont la statue monumentale de l'empereur Trajan, la fresque de Bacchus et une collection d'amphores et objets datant des origines d'Auch.

​

La fin de l'antiquité et le Moyen-Age ont également laissé de nombreux vestiges religieux et architecturaux sur cette étape gersoise des chemins de Saint-Jacques de Compostelle.